O enredo do jogo está inteiramente contido no manual. Em um futuro distante, a Terra está tão poluída que a única maneira de torná-la habitável novamente é implementar o "Projeto Renascimento da Terra", que usa grandes quantidades de energia de fusão e radiação. A humanidade teria que evacuar a Terra por um ano para que este projeto fosse concluído. O Dr. Bruford, que lidera este projeto, tem um motivo secreto. Ele usa radiação para se transformar e clona mutantes para conquistar o mundo. Para combater o Dr. Bruford, um novo projeto chamado Project Run Saber começou, que criou três ciborgues que poderiam lutar contra ele: Kurtz, Allen e Sheena. Kurtz era um protótipo com defeito e foi capturado pelo Dr. Bruford.

Run Saber apresenta um modo para um jogador e um modo cooperativo para dois jogadores. No modo para um jogador, o jogador escolhe Allen ou Sheena, e no modo para dois jogadores, um jogador escolhe Allen e o outro Sheena. Allen e Sheena são controlados de forma quase idêntica. Ambos podem pular, deslizar pelo chão, atacar com um sabre de energia, escalar paredes, se pendurar em tetos e ter um movimento especial que danifica ou mata todos os inimigos em uma sala. Por causa disso, o jogo é frequentemente comparado ao Strider, mas ao contrário do Strider, Run Saber é quase totalmente linear com poucos caminhos alternativos através das fases. A única diferença perceptível entre Allen e Sheena é que seus ataques, quando em pé no chão, atingem áreas ligeiramente diferentes. É um tanto decepcionante que os dois joguem de forma tão semelhante.

Os gráficos são realmente bem decentes. Os designs dos personagens e chefes são legais. Porém, esta é a parte "ruim", pois não existem muitos monstros diferentes. Quer dizer, alguns deles parecem muito legais, mas há apenas uma pequena quantidade deles.

A música neste jogo é incrível e vale a pena ouvi-la continuamente. Os outros efeitos sonoros não tem nada de excepcional, mas são decentes. De modo geral, a música é um ponto alto do jogo.

No total, são cinco níveis. O objetivo em cada um é simplesmente chegar à saída, seguindo um caminho linear e derrotando os inimigos pelo caminho. Cada nível termina em uma luta de chefe, e os níveis têm pelo menos alguns sub-chefes ao longo do caminho. As lutas de chefes são provavelmente os aspectos mais memoráveis ​​ou interessantes, especialmente o primeiro chefe, que se passa em um caça a jato em voo. Inimigos e powerups estão sempre no mesmo lugar todas as vezes, e inimigos e chefes têm um padrão previsível. Estranhamente, o jogador não começa com a saúde plena. Concluir o jogo pela primeira vez pode levar algumas horas, mas um jogador habilidoso provavelmente pode terminar o jogo em menos de quarenta minutos.

Embora existam três configurações de dificuldade e uma opção para ajustar o número de vidas iniciais, não há muito valor de repetição. Run Sabre é curto e razoavelmente manejável na dificuldade Normal. No geral, vale a pena uma ou duas jogadas, mas parece que mais poderia ter sido feito com o jogo para aumentar o fato replay.